内部監査チェックリストは、部門別は一般的には必要ないのでしょうか?

当店のサンプル文書におけるチェックリストに関して「部門別が無い」とのご質問ですが、ご提供させていただいているサンプル文書集の記入例があくまでも一例（全体的なもの）としてご提示させていただいていることが理由です。

本来確認しなければならないのは、審査の対象や単位を何処にするかが記載されている「個別内部監査プログラム」となります。
これを踏まえ、どの範囲や単位でチェックリストが作成されるかが決定されます。
どの単位（組織の階層や業務内容など）でチェックリストを作成するかは、品質を確保する上で組織が必要であると判断するか否かによって異なります。

ご質問にあります「部門別はなさそうなので、部門別は一般的には必要ないということでしょうか?」ということではありませんので、ご理解ください。

ちなみに、「部門別チェックリストが旧バージョンなので、新バージョンに対応するように」に関しては、バージョン（？）に合わせるように言われているものだと思いますので、部門別は関係ないかと思います。