バーチャルオフィスの入退室管理というのは、どのような扱いになるのでしょうか？

一般的な回答となりますが、個人情報の取扱いや社内外の人が個人情報に触れる可能性(会話なども含まれます）が全く無いのであれば、台帳などで入退室管理をする必要は無いかと思われます。

前提としてお話すべきことですが、「入退室管理」は、管理策（対策方法）の1つです。
どのようなリスクがあり、それによりどのような対策が必要かを検討した結果により、講じる対策も異なってきます。

よって、御社のバーチャルオフィスが、どのような状態で、どのように利用されており、どのようなものなのか等を分析した結果によっては、対策が必要かもしれません。
弊社では、その当りの状況が分かりかねますので、「対策の必要なし」とは断定することはできません。ご理解のほど、よろしくお願いします。

関連するサンプル文書としては、「P112-3.1-B 個人情報保護規程」の「3.3.3　リスクなどの認識、分析及び対策」の箇所になるかと思います。
ご参考ください。